Ta inkarnacja pochodzi z tego samego gatunku prehistorycznych gadów ziemnowodnych, co oryginalny Godzilla, choć nie wiadomo, czy te dwa osobniki były ze sobą jakkolwiek spokrewnione. Kiedy pierwszy Godzilla poniósł śmierć w trakcie poświęcenia się doktora Daisuke Serizawy w celu aktywowania Niszczyciela Tlenu, drugi Godzilla zastąpił go pewien czas później. Chociaż nie był aż tak groźny w stosunku do ludzkości jak jego poprzednik, ten Godzilla żerował na reaktorach nuklearnych i atakował w razie prowokacji ze strony wojska.
Z czasem olbrzymi potwór się obiektem badań niezależnej organizacji badawczej nazywanej Godzilla Prediction Network, której celem było studiowanie biologii gada i przewidywanie jego następnych ataków.
1999
Pewnej nocy, Godzilla wyszedł na ląd u wybrzeży miasta Nemuro, znajdującym się na wyspie Hokkaido należącej do Japonii. Tam zniszczył latarnię morską oraz elektrownie. Potem bestia powróciła do morza, udając się w stronę Tokai, gdzie znajdowała elektrownia nuklearna. Mitsuo Katagiri, głowa grupy rządowej o nazwie Instytucja Kontroli Kryzysu, wydaje rozkaz wyłączenia reaktorów elektrowni i przygotowania sił zbrojnych do konfrontacji z Godzillą w Tokai.
Tymczasem naukowcy w Japonii odkrywają ogromną skamielinę na dnie morza, liczącą sobie ponad 65 milionów lat. Skamielina ta okazała się być statkiem kosmicznym pradawnej cywilizacji kosmitów, który rozbił się na Ziemi, zmuszając jej załogę do zamienienia się w antymaterię. Kiedy naukowcy podejmują próbę zbadania jego źródła zasilania, nieumyślnie powodują reaktywację statku, który wzbija się w powietrze i odlatuje.
Następnego dnia, Godzilla znajdował się w wodach w pobliżu Tokai. Wojsko zdetonowało miny wodne, prowokując Godzillę do wyjścia na brzeg. Tam konfrontuje się z siłami japońskimi, których normalna artyleria okazuje się bezużyteczna przeciwko grubej skórze potwora. Sytuacja jednak zmienia się, kiedy ludzkość ucieka się do użycia Stalowych Rakiet, specjalnie zmodyfikowanego typu rakiet do przebijania się przez skórę Godzilli. Kilka kawałków skóry bestii zostaje oddzielonych od jego ciała, jednak rany znikają w przeciągu chwil.
Starcie przerywa nadejście statku kosmicznego, najwyraźniej poszukującego pewnego kodu genetycznego, który znaleźć można wyłącznie w ciele Godzilli. Statek rozpoczął proces skanowania potwora, a kiedy ich przypuszczenia okazały się prawdą, wystrzelili promień energii w Godzillę, wysyłając go lecącego w powietrze w pobliski budynek. Po krótkiej wymianie promieni energii, obie strony postanowiły się wycofać.
Yuji Shinoda, założyciel GPN, odkrywa sekret zdolności regeneracyjnych Godzilli, leżący w substancji o nazwie Organizer G-1, jednak UFO także o tym dowiaduje. Dlatego też odpiera wszelkie próby Sił Samoobrony Japonii do zabezpieczenia go, a następnie zmierza w kierunku Shinjuku. Po wylądowaniu na szczycie Wieży Miejskiej, UFO zaczyna kraść dane na temat Króla Potworów. ITC próbuje zniszczyć statek kosmiczny za pomocą ładunków wybuchowych, przy czym Shinoda, pragnąc dowiedzieć się czegoś więcej o cudzoziemcach, niemal ginie w eksplozji. Później dołącza do innych na dachu pobliskiego bloku miejskiego, obserwując behawior UFO, które zaczyna wysyłać sygnał o inwazji oraz nowym imperium na Ziemi. Niemal w odpowiedzi, Godzilla wychodzi na ląd i kieruje się w kierunku miasta.
Pomimo swoich najlepszych wysiłków, Godzilla zostaje unieruchomiony przez ogromny drapacz chmur zburzony przez UFO, które następnie rozpoczyna pobieranie DNA Króla Potworów. Chwilowo ukazuje swoją prawdziwą formę, Millenniana, który wykorzystuje DNA Godzilli do przystosowania się do warunków panujących na Ziemi. Nie przewiduje jednak mutagennych właściwości radioaktywnej krwi potwora, przez co zamienia się w zdeformowaną abominacje, określaną jako Orga. Wkrótce Godzilla odzyskuje przytomność i rzuca wyzwanie kosmicznemu najeźdźcy. Akceptując je, Orga staje do wygranej przez siebie walki. Ostatecznie podejmuje próbę przekształcenia się w idealnego klona Godzilli poprzez pożarcie go żywcem. Kiedy kosmita wznawia swoją transformację, Godzilla zabija go za pomocą pulsu nuklearnego. Następnie zabija sekretarza Instytucji Kontroli Kryzysu, po czym niszczy miasto.
Charakterystyka
Wygląd
Ta inkarnacja Godzilli mierzy 55 metrów wysokości, 122.5 metra długości oraz waży 25000 ton. Nie inaczej od swoich poprzedników, porusza się na dwóch masywnych nogach w pozycji wyprostowanej, używając długiego, segmentowanego ogona jako przeciwwagi. Spośród innych Godzilli wyróżnia go jednak ciemnozielona skóra pokryta kolcami, jak również niezwykle długie, postrzępione, różowawe płyty grzbietowe. Po bokach szyi kolce wydają się być dłuższe od innych, jednak gardło jest pokryte bardziej gładkimi, jaszczurzymi łuskami. Pysk jest wydłużony i nieco zaokrąglony, a w jego środku znajdują się żółte ostre zęby. Posiada także dobrze widoczne, spiczaste uszy oraz duże brązowe oczy. Stopy mają po trzy palce z pazurami, jak również przeciwstawny "kciuk".
Moce i Umiejętności
Moce
Absorpcja Energii: Podobnie jak Godzilla z serii Heisei, ten Godzilla żywi się wyłącznie promieniowaniem nuklearnym. Z tego powodu często atakuje elektrownie atomowe w celu pochłonięcia energii z tych reaktorów.
Atomowy Oddech: Jak wszyscy swoi japońscy poprzednicy, ta wersja Godzilli posiada zdolność do strzelania atomowym oddechem z pyska. Zamiast jednak być białym strumieniem gorącej pary lub błękitnym promieniem, atomowy oddech tego Godzilli jest ognisto-pomarańczowy. Posiada właściwości zapalające, tworząc ognistą eksplozję w kontakcie ze swoim celem. Wystrzał atomowego oddechu jest zawsze poprzedzany pomarańczową aurą wokół płyt grzbietowych Godzilli oraz intensywne ciepło.
Czynnik regeneracyjny: Godzilla posiada niezwykle szybki czynnik regeneracyjny, umożliwiający mu całkowite leczenie się ze wszelkich obrażeń w bardzo krótkim czasie. Sekret tej zdolności leży w substancji stanowiącej budulec komórek Godzilli, noszącej nazwę Organizer G-1 lub Regenerator G-1 w amerykańskiej wersji. Nawet oderwane kawałki ciała Godzilli mogą całkowicie wyleczyć się z każdego rodzaju obrażeń, chociaż nie utworzą nowego osobnika. Według Shinody, Organizer G-1 jest kluczem do osiągnięcia nieśmiertelności.
Puls nuklearny: Podobnie jak swój japoński poprzednik, ta inkarnacja Godzilli posiada zdolność do emitowania pulsu nuklearnego. Całe ciało Godzilli zaczyna emitować pomarańczowe światło, po czym uwalnia energię atomową we wszystkich kierunkach, tworząc falę ognia o krótkim zasięgu. Atak ten zostaje wykorzystany tylko raz w filmie, kiedy Orga podejmuję próbę połknięcia Godzilli w całości.
Zaawansowana siła: Godzilla dysponuje ogromną siłą fizyczną, pozwalającą mu na burzenie wieżowców oraz walczenie z potworami o podobnych rozmiarach. Może bez trudu obezwładniać potwory takie jak Orga, ważące 40,000 ton.
Zaawansowana wytrzymałość: Nawet bez czynnika regeneracyjnego, Godzilla jest niezwykle wytrzymały i odporny na obrażenia. Jego skóra nie odnosi obrażeń od konwencjonalnych broni używanych przez Siły Samoobrony Japonii i jedynie specjalnie zaprojektowane do tego Stalowe Rakiety są w zdolne do ranienia Godzilli. Grawitacyjne pulsy, główna broń ofensywna statku Millenniana, są zdolne do wysyłania Godzillę w powietrze, jednak potwór nie odnosi od nich żadnych zauważalnych obrażeń.
Umiejętności
Inteligencja: Godzilla wykazuje zdolność do wymyślania strategii oraz uczenia się słabości swoich oponentów w celu pokonywania ich. Kiedy dostrzega, iż Orga może zregenerować się ze wszystkich jego ataków, Godzilla pozwala mu się połknąć w całości. We wnętrzu kosmity, Godzilli udaje się wysadzić go na kawałki pulsem nuklearnym.
Pływanie: Będąc z natury gadem ziemnowodnym, Godzilla posiada świetne umiejętności pływania. Używając swojego ogona niczym wiosła, Godzilla potrafi rozwijać wysokie prędkości pod powierzchnią wody. Wydaje się być także odpornym na wysokie ciśnienie, ponieważ spędza większość czasu na dnie morza.
Ciekawostki
Podobnie jak wersja Godzilli z filmu Godzilla: Ostatnia Wojna, ta wersja Godzilli jest często mylona z dorosłym Godzillą Juniorem. W rzeczywistości jednak seria Heisei i Powrót Godzilli nie są w żaden sposób powiązane.
Jest to pierwsza japońska wersja Godzilli, która ma zieloną skórę i pomarańczowy atomowy oddech.
